Résumé de section

  • Pensez à amener votre PC portable.

    Différents logiciels seront utilisés. Vous devez les installer avant de venir à la formation. Il y en a pour environ 15 min.
    - Une version récente de R (au besoin, vous pouvez avoir plusieurs versions en parallèle)
    http://cran.rstudio.com/bin/windows/base/R-3.1.0-win.exe
    Avec les packages R suivant :
    R2WinBUGS , dlm , nlme, rworldmap , RColorBrewer , classInt , maptools, ZeBook
    pour cela ouvrir R et copier l'instruction suivante dans la console.
    install.packages(c("R2WinBUGS", "dlm", "nlme","rworldmap","RColorBrewer","classInt","maptools","ZeBook","tseries"), repos="http://cran.rstudio.com")

    - WinBUGS. Il faut windows (ou un émulateur windows sous mac ou linux) pour que winbugs fonctionne.
    http://www2.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/winbugs/contents.shtml
    1)WinBUGS14.exe pour installer le logiciel
    2)     son patch 1.4.3. Fichier à ouvrir avec Winbugs (à executer en tant qu'administrateur en cliquant droit sur l’icône créée) et à décoder
    3)La clef gratuite pour le débloquer. Fichier à ouvrir avec Winbugs (à executer en tant qu'administrateur en cliquant droit sur l’icône créée) et à décoder.
    (Les instructions détaillées sont indiquées sur la page)

    prérequis en R : c'est mieux si vous connaissez déjà un peu, sinon, on vous invite à regarder avant le cours une introduction à R (par exemple) et l'on vous aidera sur place.
    http://cran.r-project.org/doc/contrib/Paradis-rdebuts_fr.pdf

    Préparation des jeux de données
    - Si vous avez des jeux de données, nous proposons que vous les ameniez (concept d'atelier).
    Cela peut se présenter sous la forme d'un tableau excel propre qui peut ressembler à cela.
    Localisation    Année    Variable1 .... .... ....
    loc1                1950        valeur
    ...                     ...               ....
    loc1                2010          ...
    loc2                1950          ...
    ...                    ...                ...
    loc2                2010          ... 

    Si vous avez plusieurs variables ou d'autres informations bien structurées, il n'est pas nécessaire de les enlever. On vous montrera comment adapter les scripts R pour faire cela sans changer les données d'origines.

    - sinon, on vous proposera des jeux de données FAO ou Agreste sur des rendements de culture (blé...).