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  • Généralités

    Analyse de séries temporelles avec des modèles dynamiques linéaires en Agriculture.

    Atelier d'une journée jeudi 10 juillet 2014 de 9h30 à 17h30 à Paris

    Vous avez des séries annuelles de rendement à l'échelle régionale, ou d'autres séries temporelles intéressantes pour votre filière, et vous chercher à en analyse les évolutions passées et à prédire la tendance à venir ? Alors, vous pourriez être intéressé par cet atelier d'une journée sur l'analyse de telles données en utilisant les modèles dynamiques linéaires avec le logiciel R. Il consistera en une formation théorique et pratique (le matin) et une mise en œuvre sur vos propres données.

    jeudi 10 juillet 2014 de 9h30 à 17h30

    lieu : MNE

    Intervenants : David Makowski (INRA, Grignon), Lucie Michel (thèse ACTA/INRA) et Juliette Adrian (INRA, Grignon)

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    Programme (provisoire)

    9h30-10h. Introduction sur les séries chronologiques (30 min): David Makowski
    Régression linéaire et non-lineaire (linéaire, Q, C, LP)
    • 10h00-10h45. Cours (45min): Lucie Michel
    • 10h45-11h45. TD (1h)
    Pause : 15min
    Modèle linéaire dynamique (classique, bayésien)
    • 12h-12h45. Cours (45min): David Makowski

    Déjeuner
    • 14h-14h45. Package (45min): Juliette Adrian
    • 14h45-15h45. TD (1h)
    Pause: 15min
    16h-17h30. Atelier (1h30)

    • Présentations et supports

    • Installation et préparation

      Pensez à amener votre PC portable.

      Différents logiciels seront utilisés. Vous devez les installer avant de venir à la formation. Il y en a pour environ 15 min.
      - Une version récente de R (au besoin, vous pouvez avoir plusieurs versions en parallèle)
      http://cran.rstudio.com/bin/windows/base/R-3.1.0-win.exe
      Avec les packages R suivant :
      R2WinBUGS , dlm , nlme, rworldmap , RColorBrewer , classInt , maptools, ZeBook
      pour cela ouvrir R et copier l'instruction suivante dans la console.
      install.packages(c("R2WinBUGS", "dlm", "nlme","rworldmap","RColorBrewer","classInt","maptools","ZeBook","tseries"), repos="http://cran.rstudio.com")

      - WinBUGS. Il faut windows (ou un émulateur windows sous mac ou linux) pour que winbugs fonctionne.
      http://www2.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/winbugs/contents.shtml
      1)WinBUGS14.exe pour installer le logiciel
      2)       son patch 1.4.3. Fichier à ouvrir avec Winbugs (à executer en tant qu'administrateur en cliquant droit sur l’icône créée) et à décoder
      3)La clef gratuite pour le débloquer. Fichier à ouvrir avec Winbugs (à executer en tant qu'administrateur en cliquant droit sur l’icône créée) et à décoder.
      (Les instructions détaillées sont indiquées sur la page)

      prérequis en R : c'est mieux si vous connaissez déjà un peu, sinon, on vous invite à regarder avant le cours une introduction à R (par exemple) et l'on vous aidera sur place.
      http://cran.r-project.org/doc/contrib/Paradis-rdebuts_fr.pdf

      Préparation des jeux de données
      - Si vous avez des jeux de données, nous proposons que vous les ameniez (concept d'atelier).
      Cela peut se présenter sous la forme d'un tableau excel propre qui peut ressembler à cela.
      Localisation    Année    Variable1 .... .... ....
      loc1                1950        valeur
      ...                     ...               ....
      loc1                2010          ...
      loc2                1950          ...
      ...                    ...                ...
      loc2                2010          ... 

      Si vous avez plusieurs variables ou d'autres informations bien structurées, il n'est pas nécessaire de les enlever. On vous montrera comment adapter les scripts R pour faire cela sans changer les données d'origines.

      - sinon, on vous proposera des jeux de données FAO ou Agreste sur des rendements de culture (blé...).

      • Références